Merhaba Mrnone,
Oluşturduğunuz sertifika şablonunun alınabilecek sertifikalar arasında olmasını istiyorsanız izlemeniz gereken yol şu:

Start => Administrative Tools => Certification Authority => Certificate Templates => Right Click New => New => Certificate Template to Issue

açılan pencereden oluşturduğun sertifikayı seçip OK tuşuna başıyorsun ve artık bu sertifika dağıtılabilir duruma gelir.