eğer iis domain member değilse.. şu yapıda olacak..

oncelikle kendine bir folder belirleyeceksin..
mesela
c:\FTP
sonra her kullanıcının özelliklerine gidip profile path olarak C:\FTP göstereceksin..
sonra C:\FTP içine LocalUser diye bir folder açacaksın..
LocalUser içinede her kullanıcının Emre Aydın`ın dediği gibi username ile aynı olacak sekilde folderlar açacaksın..o folderlara kullanıcıların NTFS haklarını gerektiği sekilde ayarlayacaksın..

FTP server ıda c:\FTP olarak goster..

bunlar olunca
bahattin ve dac diye kullanıcı var diyelim..
bahattin girdiginde
c:\FTP\LocalUser\bahattin
dac girdiginde
c:\FTP\LocalUser\dac
görecektir....

eğer iis domain member ise..
LocalUser yerine DomainUser yazacaksın..
Kolay gelsin..